净化车间生产用水的供水管道应采用不易生锈的管道，供水方向应逆向加工工艺方向，即从清洁区流向非清洁区。净化车间的供水管道应尽可能统一，冷水管道应避免从操作台上方通过，以免冷凝水凝结滴落到产品上。为防止水管外不洁的水被虹吸回流到管道中，真空消除器须安装在水管的适当位置。净化车间的排水沟应铺设表面光滑、不渗水的材料。

施工过程中不得出现不均匀和裂缝，并形成3%的倾斜度，以保证车间排水的畅通。排水方向也从清洁区排放到非清洁区。活动蓖麻应由不锈蚀材料制成。车间排水地漏应采取防止固体进入的措施。畜禽加工厂的浸渍和打毛间应采用明沟，以清除羽毛和污水。排水管出口设防鼠网罩，净化车间的地漏或排水管出口用有U形、P形、S形等存水弯封，以防虫蛀及臭味。